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Base santanderino, que con veintisiete años llegó junto a Fernando Román de manos del representante de ambos, Miguel Ángel Paniagua, al Caja San Fernando. "Manu" Rodríguez, como se le conocería en Sevilla venía de jugar en el Tizona burgalés y en el Pamesa Valencia, con el que logró el ascenso a la máxima categoría en la temporada anterior. Por tanto, llegaba un base experimentado a tierras hispalenses a conformar un equipo aspirante al ascenso.

De hecho, su rendimiento en la 1988-1989 fue bueno en las primeras jornadas, aunque alternando buenos partidos con otros no tanto, siempre ayudó en la anotación y se distinguió por su lucha y capacidad de robo de balón. Sin embargo, las lesiones se cruzaron en su camino, primero levemento haciendo que se perdiera la jornada 4 y, posteriormente con más gravedad. En la jornada 18, acaba el partido ante CajaHuelva dolorido, y las exploraciones determinan una fractura de escafoides, con lo que el periodo de recuperación lo dejaría inactivo hasta final de temporada. Finalmente, pudo llegar a los dos últimos partidos, los del ascenso ante Syrius Patronato. 19 partidos en total, anotando 8,5 puntos por partido. Segundo ascenso consecutivo para él.

A pesar de la lesión, Pesquera confía en él para acompañar en la dirección al flamante fichaje cajista procedente de CajaBilbao, 'Chinche' Lafuente. De manera que en la temporada 1989-1990 debutaría en la máxima competición nacional. Pero el mal fario no abandonaba al cántabro. En la pretemporada, en Covadonga, en el primer entrenamiento choca con Garrido y se fractura el maxilar teniendo que ser operado.

Afortunadamente llega a la primera jornada y consigue disputar todos los partidos de liga, salvo el último ante Maristas en PlayOffs de clasificación. Alterna partidos de muchos minutos, sobre todo aquellos en los que "Chinche" es baja, con otros en los que no llega a la decena. Firma su mejor partido en Valladolid ante el Forum, donde logra 12 puntos, su tope de anotación en la temporada. Sin embargo, no se prodiga demasiado en la anotación y su porcentaje en tiros libres no es del todo bueno (61%). Finaliza la temporada disputando 39 partidos y sumando 3,6 puntos por partido y poco más de una asistencia por choque en 21 minutos en pista.

Al acabar la campaña concluye su contrato con el Caja San Fernando y se desvincula del club tras dos temporadas, la primera marcada por las lesiones y la segunda que se convertiría en su debut en ACB. Sin embargo, Pesquera prefirió fichar a otro base en lugar de renovar al cántabro.